Certains historiens pensent qu'un Prieuré, sans doute la pièce principale des caves, aurait pu exister avant cette fondation. La Chartreuse de Pomier comprenait à l'intérieur de ses murs, entre autres : l'Église Notre-Dame de Pomier, trois chapelles, les douze cellules des Chartreux entourant le grand cloître où étaient enterrés les Chartreux ainsi que des membres de la famille des Comtes de Genève et de Vaud.
Quatre-vingt-onze Prieurs se sont succédés à la tête de la Chartreuse. Durant son existence, la Chartreuse recevra de nombreux visiteurs illustres en particulier l'Empereur Sigismond et Charles IV. Ce dernier place le monastère sous la protection du Saint Empire Romain Germanique par une bulle scellée en 1366.
Les estampes de la chartreuse